法国数字PCR荧光通道

时间:2022年12月01日 来源:

在定量PCR时,我们常常纠结一个问题,究竟是相对定量还是***定量呢?如今,你无需纠结了,因为数字PCR(digitalPCR)来了。尽管这两种技术有些类似,都是估计起始样品中的核酸量,但它们有一个重要的区别。定量PCR是依靠标准曲线或参照基因来测定核酸量,而数字PCR则让你能够直接数出DNA分子的个数,是对起始样品的***定量。因此特别适用于依靠Ct值不能很好分辨的应用领域:拷贝数变异、突变检测、基因相对表达研究(如等位基因不平衡表达)、二代测序结果验证、miRNA表达分析、单细胞基因表达分析等。国产dPCR企业在上述应用领域不断与伯乐、赛默飞、罗氏、凯杰、因美納等头部企业展开竞争,抢占市场份额。法国数字PCR荧光通道

dPCR在使用过程中需要特别注意体积误差造成的结果偏差。体积误差对于测量拷贝数浓度会产生偏差。目前dPCR中体积优化方法以光学显微镜观测为主。分散体积的差异会增加拷贝数结果的不确定性,Emslie等使用光学显微镜纵向拍照比较图片边缘的微小差异,考察了数字PCR系统中每个微孔内和孔与孔间的体积差异对实验结果的影响程度。Corbisier等使用微滴数字PCR对6种不同质量分数棉籽粉质粒DNA标准物质[ERM-AD623a-f,浓度范围(10~10)copies/ul]进行分析,优化了液滴体积得到相应校正因子,并使用该校正因子发现并校准了运行软件中液滴体积不变的假设而引起的数据偏离,数据结果的一致性有明显提高。苏州微滴式数字PCR生命科学用品Drop-off数字PCR检测方法的**主要优势是能够能够在一个反应中检测到基因组序列范围短的同源基因突变。

对于检测需要高灵敏度以及技术确认的情况下,数字PCR技术也可以发挥重要作用。技术数据表明,数字PCR技术对的比较低检测下限可到2copies/ml,比qPCR灵敏度提升了100倍。经测试,数字PCR在检测和诊断的某些方面优于金标准qPCR,尤其是在低病毒载量样本中,相比起qPCR,数字PCR特异性、灵敏度、重现性和检测限受影响更小。因此,未来预计数字PCR技术也将在类疾病中得到更加广的应用。数字PCR的应用甚广,除了可应用于进行突变的检测以外,也可运用于基因扩增的检测。通过数字PCR技术可建立多重荧光体系,用于同时检测比如非小细胞肺中常见的MET和HER2耐药扩增。有研究报道,使用数字PCR技术对436例非小细胞肺样品进行检测,并挑选样本验证了数字PCR与RNA fish的检测一致性。结果表明,该数字PCR技术在保证了基因扩增检测准确性的同时,还节约了检测时间。

目前全球数字PCR的市场规模约1.5亿-2.5亿美元,约占荧光定量PCR市场规模(约20亿美元)的10%,但增长趋势明显,有望逐步替代荧光定量PCR技术。目前国际市场有伯乐、赛默飞、凯杰、Stilla、罗氏等主要数字PCR玩家。根据MordorIntelliaence研究报告预测,2019-2024年全球qPCR和dPCR市场将以8.8%的年复合增长率增长,从2014年的41.13亿美元增长到2024年的62.7亿美元。其中,dPCR的增速更快达11.9%,将从2014年的4.75亿美元,增长到2024年8.34亿美元,为PCR检测带来极大的市场。但其预测的发展趋势仍有参考价值。dPCR可直接溯源SI国际单位制摩尔,适合单一、双重及多重转基因标准物质研究,一次可识别不同的转基因区域。

数字PCR系统通过其独特的微流体阵列式芯片板(MAP)技术,提供强大而易于使用的数字PCR体验。这种专有技术可实现对样品进行一致的自动腔室化,可将一份样品腔室化至20,000个微反应室,其变异系数(CV)达到比较好的<1%。与其它数字PCR系统不同,MAP技术不使用乳液或其它基于液滴的方法对反应进行腔室化。而是利用分配通道将试剂递送至微反应室,具有高精密度和一致性。此外,QuantStudioAbsoluteQ系统可分析加载样品的95%以上,确保获得高度准确的数字PCR结果。目前dPCR中体积优化方法以光学显微镜观测为主。上海微滴式数字PCR油滴制造

数字PCR通常采用大量分区。法国数字PCR荧光通道

目前dPCR主要有两种形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。可以使用几种不同的方法来分配样品,包括微孔板,毛细管,油乳剂和带有核酸结合表面的小型化腔室阵列。样品的分配使人们可以通过假设分子种群遵循泊松分布来估计不同分子的数量,根据泊松分布的原理,反应体系中目标分子的拷贝数可以通过公式A=-ln[(N-X)/N]*N计算,从而解决了多个目标分子存在于单个液滴中的可能性。法国数字PCR荧光通道

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