深圳锐讯数字PCR分析应用

时间:2023年01月16日 来源:

全自动样本制备系统DMX-1000配备气流发生装置和气压控制装置,能够实现高精度压力控制,结合**产品液滴生成芯片和微流控乳液滴生成技术,DMX-1000可以在70秒内快速、稳定、高效地生成大小均一的微乳液滴。微滴数量可达2万-60万个,粒径范围30-120μm,性能稳定。除此之外,锐讯还提供微流控芯片的定制服务,以满足不同的液滴数目和尺寸要求。平板式快速扩增仪TC-1000,不再使用传统的96孔板,而是特制的液滴扩增芯片;不再是传统的“烧开水”加热模式,代之以平板式单液滴层均匀受热的方式。在这样的改进之下,TC-1000完成40个PCR循环只需约45分钟(TC-2.0升级版更是把时间缩短到了25分钟!),大幅缩短了等待时间,提升了实验进度。这对实验人员而言,无疑是莫大的福利——高效完成工作,不加班——爱工作,也爱生活。从市场规模来看,目前数字PCR市场规模并不大,全球约1.5亿至2.5亿美元。深圳锐讯数字PCR分析应用

在荧光定量PCR应用已经如此的情况下,缘何数字PCR仍然能横空出世?中心点在于荧光定量PCR尽管为科研和临床市场应用提供了非常重要的检测工具支撑,但仍然有尚未被满足的客户需求。荧光定量PCR需要基于标准品制作的标准曲线进行定量,属于相对定量,操作较为复杂,且终端用户对其结果的重复性、灵敏性、精密度、分辨率、对PCR反应抑制剂的耐受性等方面有更高的期待。数字PCR通过将反应体系进行有限稀释至成千上万的反应单元中,实现了核酸靶标的单分子扩增。PCR扩增结束后,基于终点法对阳性液滴数和总液滴数进行计数,结合泊松分布原理,从而实现对起始样本的定量。其极大地简化了操作步骤,并且大幅提高了检测性能,尤其在低丰度或较低丰度的核酸检测上(灵敏性可达0.001-0.0001%),其优异的性能得到了终端用户的认可。深圳微滴式数字PCR市场前景数字PCR等新兴技术要在临床应用上得到爆发式增长,有赖于LDT市场的放开。

了解泊松分布,我们先要从二项式分布说起,二项式分布是一个离散概率分布,它给出了m次试验中k次成功的可能性,每次试验的概率为p,例如当掷骰子时,二项分布给出了在10次试验中恰好有7次掷出4的概率。在数字PCR的情况中,投掷骰子类似于将一个目标实体随机“投掷”到一组分区中,当目标落在选定的分区中时,就是成功。如果有n个分区,并且分区过程是完全随机的,则目标出现在所选分区中的概率为1/n。该试验重复m次,样品中的每个分子一次。如下所示的二项式分布给出了k个成功的概率,即所选分区恰好包含k个分子的概率。数字PCR通常采用大量分区。当n很大,并且尝试成功的概率(1/n)很小时,二项分布可以近似为泊松分布。

数字PCR实验步骤包括:1)试剂配制:将10xdPCRBuffer、dPCR酶、引物和探针、无核酸酶水混合成dPCR预混液,并分装到8联排管中或96孔板中;将各待测样本的核酸模板、阳性对照、阴性对照分别加入相应的8联排管中或96孔板中;2)芯片进样:在小海龟BioDigital·青全自动样品处理系统上进行芯片上反应液进样和液滴生成;3)芯片扩增:在小海龟BioDigital·青PCR扩增仪上进行芯片上PCR扩增反应;4)芯片阅读:在小海龟BioDigital·青生物芯片阅读仪上进行芯片上荧光信号阅读;5)数据分析:使用生物芯片数据分析·青软件进行数据分析和报告导出;数字PCR是通过将一个样本分成几十到几万份,分配到不同的反应单元,每个单元至少包含一个拷贝的目标分子 。

相比于cPCR技术和第二代qPCR技术,dPCR技术具有定量,可溯源至SI国际单位制摩尔;基质成分干扰较小[51];灵敏度高;对抑制剂的敏感性较低;适合多重转基因检测[52.53],可提高分析效率;实验条件优化简单[54]对实验条件优化的要求较低,适合多重基因检测等优势,可为转基因农作物提供准确的量值保证,目前dPCR仪器的价格仍然十分昂贵,但随着系统加工工艺的改进以及使用较便宜的材料,聚合成更小的体积[556],其价格将会不断的降低,使其应用到更多的检测中。数字PCR在检测珍贵样品和样品核酸存在降解时具有明显的优势。深圳锐讯数字PCR分析应用

无创产前筛查有望成为数字PCR在临床快速落地的应用。深圳锐讯数字PCR分析应用

无创产前筛查有望成为数字PCR在临床快速落地的锏应用。首先,无创产前筛查领域对于兼顾成本、准确性、速度的创新技术的需求还未满足。其次,无创产前筛查市场空间庞大,虽说中国每年新生儿的增长速度正在放缓,但每年仍有超过1000万的新生儿,带来了巨大的想象空间。2022年6月,郑大一附院遗传与产前诊断中心、塔歌生物联合在JournalofTranslationalMedicine(影响因子5.531)杂志上发表文章,验证了数字PCR作为T21,T18和T13产前筛查方法的可行性,这是世界上报道在真实临床条件下通过盲检实现一管反应可从孕妇血浆样本中同时检测出T21、T18和T13的数字PCR无创产前筛查试剂盒。文章显示,塔歌生物胎儿染色体非整倍体无创产前筛查数字PCR试剂盒总体筛查的灵敏度为100%,特异性为95.12%,均优于血清学筛查。除准确率高之外,塔歌生物的产品还拥有成本低、操作简便,及检测速度快等优势,可以加速无创产前筛查在各级医院,特别是基层地区普遍落地,助力中国出生缺陷防控。深圳锐讯数字PCR分析应用

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