苏州数字PCR分析应用

时间:2023年02月28日 来源:

目前全球数字PCR的市场规模约1.5亿-2.5亿美元,约占荧光定量PCR市场规模(约20亿美元)的10%,但增长趋势明显,有望逐步替代荧光定量PCR技术。目前国际市场有伯乐、赛默飞、凯杰、Stilla、罗氏等主要数字PCR玩家。根据MordorIntelliaence研究报告预测,2019-2024年全球qPCR和dPCR市场将以8.8%的年复合增长率增长,从2014年的41.13亿美元增长到2024年的62.7亿美元。其中,dPCR的增速更快达11.9%,将从2014年的4.75亿美元,增长到2024年8.34亿美元,为PCR检测带来极大的市场。但其预测的发展趋势仍有参考价值。数字PCR的应用甚广,除了可应用于进行突变的检测以外,也可运用于基因扩增的检测。苏州数字PCR分析应用

Drop-off实验包括两个针对相同扩增子的TaqMan探针:与野生型序列互补而与突变位点不发生互补的Drop-off探针和与突变型和野生型基因都互补的Reference探针(如图1A)。在野生型等位基因的存在下,Drop-off探针和Reference探针都将与目标杂交,产生双重阳性信号(如图1B,蓝色群)。相反,如果存在突变的等位基因,即使一个核苷酸的突变也会阻止Drop-off探针与之杂交,因此只有Reference探针对目标基因进行退火,从而得到一个阳性信号。广州双螺旋生物仪器数字PCR试剂盒臻准推出新款数字PCR产品:AccuONE2.0数字PCR系统。

在PCR进行的过程中,首先是引物和探针分别结合,然后开始扩增。如果一个微滴当中有目标基因的片段,Taqman探针就会被酶切碎,荧光基团和淬灭基团分离。在后面的检测过程中,荧光基团被激发光路激发之后就会发荧光。如果没有,Taqman探针就不会被切碎,在后面的检测过程中,荧光基团吸收到激发光的能量,就会被淬灭基团给淬灭,那么仪器就检测不到这个微滴的信号。检测的过程中,并不是说一个样本中检测到了几个亮点,这个反应当中就有几个目标基因的拷贝。因为目标基因的片段,在微滴当中的分布,是符合泊松分布的(也就是说进不进的概率相等,并且相互独立)。所以,一个发光的微滴中,可能有一个或者三个四个,甚至更多个目标基因的拷贝。因此,发光的微滴数与原始的基因拷贝数并不是一对一的对应关系。

数字PCR平台的评价指标有:分割单元数,荧光通道数,操作复杂性和污染风险。但是重要的是检测准确性,评估数字PCR平台的一种方法是使用多个数字PCR平台互相验证,另一种方法是使用定值准确的标准物质。目前的三代的PCR技术各有各的优缺点,也各有各的应用领域,并不是一代取代一代的关系。技术的不断进步给PCR技术注入了新的活力,使其能解锁一个又一个的应用方向,使核酸检测更方便、更准确。目前dPCR仪器的价格仍然十分昂贵,但随着系统加工工艺的改进以及使用较便宜的材料,聚合成更小的体积[556],其价格将会不断的降低,使其应用到更多的检测中。在数字PCR赛道,塔歌生物将加速胎儿染色体非整倍体无创产前筛查注册证的申报。

无创产前筛查有望成为数字PCR在临床快速落地的锏应用。首先,无创产前筛查领域对于兼顾成本、准确性、速度的创新技术的需求还未满足。其次,无创产前筛查市场空间庞大,虽说中国每年新生儿的增长速度正在放缓,但每年仍有超过1000万的新生儿,带来了巨大的想象空间。2022年6月,郑大一附院遗传与产前诊断中心、塔歌生物联合在JournalofTranslationalMedicine(影响因子5.531)杂志上发表文章,验证了数字PCR作为T21,T18和T13产前筛查方法的可行性,这是世界上报道在真实临床条件下通过盲检实现一管反应可从孕妇血浆样本中同时检测出T21、T18和T13的数字PCR无创产前筛查试剂盒。文章显示,塔歌生物胎儿染色体非整倍体无创产前筛查数字PCR试剂盒总体筛查的灵敏度为100%,特异性为95.12%,均优于血清学筛查。除准确率高之外,塔歌生物的产品还拥有成本低、操作简便,及检测速度快等优势,可以加速无创产前筛查在各级医院,特别是基层地区普遍落地,助力中国出生缺陷防控。在使用dPCR进行转基因检测时,通常直接参照qPCR的方法。上海臻准数字PCR技术

数字PCR是通过将一个样本分成几十到几万份,分配到不同的反应单元,每个单元至少包含一个拷贝的目标分子 。苏州数字PCR分析应用

数字PCR技术流分类目前,dPCR的基本方法都已经建立,根据反应单元的不同形式,主要可分为微板式、微腔式和和微滴式三大类系统。微液滴制备的方法,目前主流的有四种:1)芯片微孔物理分割法,俗称物理分隔法,公司有Fluidgm,Qiagen,Roche,ThermoFisher,;2)液滴分割法,俗称油包水,代替公司有Bio-Rad;3)杂交式芯片液滴法,公司有Stilla;4)注射振动制滴法。PS:芯片式物理分割技术所有已经过期,目前有不少公司在这个技术的基础上进行开发,例如罗氏。苏州数字PCR分析应用

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