德国全自动数字PCR分析应用

时间:2023年05月29日 来源:

在精细诊疗领域,患者外周血中的循环DNA(ctDNA),在的早期筛查,围术期监测,药物疗效评估,预后等方面具有重要的临床应用价值。在肺液体活检领域,EGFR突变由于其在东亚人群中的高突变率,实现精细检测显得尤为重要。研究表明,相较于荧光定量PCR,数字PCR对于血液ctDNA的检测灵敏度更高(0.01%),EGFR突变的阳性检出率也更高。在患者术后复发检测中,数字PCR评估出的ctDNA阳性,可以早于影像学数月提前揭示出患者复发。因此,该项技术在肺精细诊疗中具有重要的作用。国产dPCR企业在上述应用领域不断与伯乐、赛默飞、罗氏、凯杰、因美納等头部企业展开竞争,抢占市场份额。德国全自动数字PCR分析应用

使用ddPCR的一个主要优点在于,定量不是相对的。微滴式数字PCR计算事件的数量,因此可以确定检测极限和比较低起始量,以便达到所需的灵敏度。在连续监控或比较不同患者的效果时,这可以更准确地比较负荷,因为所测得的丰度不是相对的。经过实验证实,ddPCRKRASG12/G13ScreeningKit也能够检测患者cfDNA样品中的KRAS突变(图2)。这些患者的血浆样品购自ConversantBio和ProMedDx,之前已通过FFPE基因分型被分为KRAS突变阳性或阴性。欢迎咨询广州双螺旋科学仪器有限公司。一体化数字PCR技术数字PCR是定量技术,基于单分子PCR方法来进行计数的核酸定量,是一种定量的方法。

微滴数字PCR主要是将两种互不相溶的液体,以其中一种作为连续相(油),另一种作为分散相(水),在水/油两相表面张力和剪切共同作用下分散相以微小体积单元的形式存在于连续中,从而成液滴。这种液滴式的反应腔室具有体积小、样品间无扩散等优势。在ddPCR中,利用微滴发生器可以一次生成数万乃至百万个纳升甚至皮升级别的单个油包水微滴,作为数字PCR的样品分散载体。这里,液滴中包裹了单拷贝DNA模板和PCR反应液,然后将液滴收集在PCR反应管中进行扩增。PCR反应结束后检测每个微滴的荧光信号。目前Bio-Rad公司的QX100系统、QX200系统均为采用液滴技术的数字PCR系统。图6.Bio-Rad的液滴数字PCR系统

由于现有的商业化数字PCR设备在物理上只设置了2个检测通道,所以存在一个明显的短板:不能同时进行多个位点的检测。在样品多位点的检测中,就需要更多的起始样品,但临床上组织的样品非常有限。相比之下荧光定量PCR仪上就很容易实现多重检测。为了考察利用数字PCR实现多重检测的可能性,英国TheInstituteofCancerResearch的研究人员以非小细胞肺相关的KRAS基因为检测对象,在Bio-Rad的数字PCR系统上通过3个三重ddPCR检测体系来实现9个KRAS突变位点的检测。在使用dPCR进行转基因检测时,通常直接参照qPCR的方法。

基于微滴的QX100dPCR仪,利用油包水技术,将样品平均分配到20000个微滴油包水中,利用微滴分析仪对微滴进行分析。2012年RainDance公司推出了RainDropdPCR仪,在高压气体驱动下,将每个标准反应体系分割成包含100万至1000万个皮升级别微滴的反应乳液。数字PCR就形成了2大派别,芯片式和微滴式。不论是哪种数字PCR,其原理都是有限稀释,终点PCR和泊松分布。将含有核酸模板的标准PCR反应体系,平均分配成几万个PCR反应,分配到芯片或微滴中,使每个反应中尽可能含有一个模板分子,进行单分子模板PCR反应,通过读取荧光信号的有或无进行计数,经过统计学泊松分布的校准进行定量。20世纪末,Bert Vogelstein等提出数字PCR的概念。上海进口数字PCR性能特点

从市场规模来看,目前数字PCR市场规模并不大,全球约1.5亿至2.5亿美元。德国全自动数字PCR分析应用

3D数字PCR为液体活检提供技术支持液体活检是一种非侵入性的检测基因及临床效果的一种方法,目前可能正在开展有关3D数字PCR在在液体活检中的疗效,为后期临床提供更多可靠的指导作用。报道称“无创伤性肺检测技术即将登陆中国”。随着基因检测技术,如类似3D数字PCR技术的发展,推动我们将进入了“DNA的应用商城”这样的新时代,如23andme、华大基因等专业的检测服务机构,提供更加专业的基因检测结果,经基因报告解读师或遗传咨询师进行通俗的解读,让我们每一个人都能够了解自己的基因,拥有自己的“生命之书”,让我们更加健康的生活。精细医疗其实本质是应用生物学信息与大数据科学的交叉发展的新型医学概念与医疗模式。对于精细医疗,重点在于“精细”,不仅只是简单的基因测序如此简单,更需要精细的诊断与精细的。德国全自动数字PCR分析应用

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