上海相对定量qPCR仪使用说明

时间:2023年06月01日 来源:

双杂交探针是两个特异性探针,一个只5’端标记荧光基团,另一个只3’端标记猝灭基团。这两个探针序列和模板特异性结合,结合的位置非常邻近。在qPCR反应的退火阶段,当两个探针与模板结合时,位于两个探针头尾的荧光基团之间产生FRET现象,促进受体的荧光基团释放一种波长的荧光信号,从而达到实时监控反应进程的目的。Amplifluor系统包括两个特异性引物和一条检测探针(UniPrimer),其中一条引物的5’末端带有部分序列和UniPrimer的3’末端部分序列相同。UniPrimer两端分别被荧光和淬灭基团标记且有发卡结构。反应时,UniPrimer结合到特异性引物扩增出的模板上作为引物进行PCR反应,在延伸的过程中UniPrimer发夹结构打开,荧光信号释放。蝎形引物为茎环结构,其5’端带有一个荧光基团FAM,3’端带有一个淬灭基团DABCYL,其环的部分序列和模板完全互补配对。体系有模板时,茎环结构稳定,荧光和淬灭基团相距近,不能检出荧光信号;体系无模板时,蝎形引物和模板特异性结合并起始PCR扩增,蝎形引物的环结构与扩增出的模板互补杂交,导致茎环结构被破坏,释放出大量的荧光信号,荧光仪器可以实时收集这些荧光信号并生成相应的荧光扩增曲线。TaqMan方法通过采用荧光探针在PCR循环过程中随着特定PCR产物的累计而对其进行检测。上海相对定量qPCR仪使用说明

TwoSteprt-pcr和OneSteprt-pcr的选择RealTimeRT-PCR反应可选择TwoSteprt-pcr反应或OneStepRT-PCR反应,TwoStepRT-PCR反应是将反转录反应和RealTimePCR反应分两步进行。进行TwoStepRT-PCR反应时,可选择RandomPrimer、OligodtPrimer或基因的特异性引物进行反转录反应,然后再将一部分反转录反应液(cDNA)作为模板添加到RealTimePCR反应液中。使用反转录引物时可以根据实验目的选择合适的反转录引物,如果选择RandomPrimer或OligodtPrimer,合成的cDNA可用于复数种类基因的检测,cDNA溶液可以稳定地长期保存,供以后解析使用。OneSteprt-pcr的反转录反应和PCR反应在同一反应管内连续进行,操作简单,污染几率低。但此时的反转录反应和PCR反应都并非为各自的适条件,所以OneSteprt-pcr通常比TwoStepRT-PCR反应效率低。此外,与TwoStepPCR反应相比,反转录酶等的使用量多,每个反应的成本相对较高。OneSteprt-pcr反应的反转录反应引物只能使基因的特异性PCR下游引|物,而不能使用Randomprimer或OligodtPrimer共用引物。基因表达解析等绝大部分RT-PCR,适合选择TwoSteprt-pcr反应,而RNA病毒检测等以基因检测为目的RT-CR反应,应优先考虑防止污染,所以比较好选择OneSteprt-pcr反应。广州快速qPCR仪型号为了增加qPCR实验可靠性、重复性,需要制定统一的实验标准来进行规范。

dPCR比qPCR准确度与精密度高。qPCR的效率会受到很多因素影响。例如:试剂保存不当导致部分样本降解、标准曲线偏斜导致CT值受到影响。dPCR 将样本分成若干小的 PCR 反应分区,可实现单分子检测,避免模板间的竞争效应的影响,可提高目的序列的检测准确度。由于dPCR较少受到扩增效率的影响,因此具有更高的准确度与精密度。qPCR面对小的差异较弱,dPCR则可识别差异较小的拷贝数。dPCR比qPCR重复性和通用性高。qPCR只能实现相对定量,即必须使用标准品生成标准曲线,才能进行定量。dPCR是定量,不需要利用标准品绘制标准曲线,也不依赖荧光信号到达设定阈值时所经历的循环数,直接计算样品中目的核酸分子的个数,可实现定量,重复性和通用性高 。因此dPCR可用于常规qPCR所需的标准品定量,具有计量学意义 。

定量首先需要建立Ct值和拷贝数之间的线性关系,即标准曲线,标曲需要由标准品生成,标准品中基因序列要与待测样品中基因序列一致,从而保证引物在两者中扩增效率完全相同,标准品来源可以是质粒,纯化的PCR产物或者基因组DNA等。标准品在加样时需要注意体积比较好大于2微升,以减少标曲误差,标曲是由不同梯度标准品生成,每个标准品梯度建立Ct值与拷贝数对数值之间的联系,落在标曲上的梯度点比较好有5个及以上,至少3个点。标准品和待测样品同时反应,将待测样品检测的Ct值代入标曲后即可换算出待测样品中基因的拷贝数。qPCR通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。

PCR 反应中通过控制温度变化使得核酸分子重复地解链与延伸,从而实现对目的片段的指数扩增。因此,准确的温度控制与快速的变温系统是实现高效的 qPCR 实验的基础与关键。加热块各处温度越一致,则因位置差异。而带来的样品之间的扩增效率差异越小。q225 系列荧光定量 PCR 仪突破性地采用了复合式液体冷却循环系统,极大的消除了单一风冷散热器所带来的温度均一性差、降温速率慢、仪器噪音大等缺陷,可将96 孔间温度差控制在±0.15°C 以内,确保每一孔内的实验均严格按照您所设置的控温程序进行。qPCR 反应所需时间很大程度上取决于对反应溶液进行变温所需要的时间,而这一过程又受到加热块升降温速度和液体升降温速度两方面的影响。q225 所使用的热循环系统峰值变温速率可达4°C/s,更重要的是,经过精密设计的加热块能够很大程度地贴合孔板形状,实现高效的热传导,使得在加热块达到预定温度后反应溶液也能在短时间内达到相同温度,反应溶液温度更为均一。q225 出色的热循环系统设计使得40 个循环的常规 qPCR 可以在短短43 分钟内轻松完成,让您的工作效率获得质的提升 。。q225 所使用的热循环系统峰值变温速率可达4°C/s。单通道qPCR仪供应商

自聚合酶链式反应技术被发明以来,其简单、可靠、快速、灵敏的质量,PCR是分子生物学中使用的技术。上海相对定量qPCR仪使用说明

PCR方法:PCR的原理在这里不需要进一步解释。多年来,研究人员基于此开发了一系列衍生技术。当前的PCR方法可分为三类:终点PCR,qPCR和dPCR。终点PCR:端点PCR是原始,简单的PCR方法,并且仍然被使用。PCR反应完成后,用户只能通过凝胶电泳,毛细管电泳等方法检测产物。终点PCR本身无法量化,因为反应产生的DNA数量可能无法反映初始情况。例如,不同样品和序列之间的扩增效率存在差异。DPCR通常更准确。 qPCR可以轻松区分两倍的浓度差异(例如5个拷贝和10个拷贝),但是面对小的差异,它却较弱。 dPCR理论上可以识别相差少于20%的拷贝数,例如5和6拷贝。该准确度对于量化涉及染色体重排的基因的拷贝数或量化患者血液中的循环生物学指标特别有用。由于dPCR相当于在反应结束时稀释样品并读取数据,因此dPCR比qPCR对抑制剂的抵抗力更高。上海相对定量qPCR仪使用说明

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