上海灵敏度qPCR仪设置

时间:2023年06月07日 来源:

阴性对照一般是指用水代替模板的反应孔,体系中除了模板,包括了其他的反应组分。由于qPCR的高灵敏性,阴性对照有出现扩增信号的情况,那么在针对这类问题时,我们需要判断其原因所在。使用染料法进行qPCR实验时,首先查看阴性对照的溶解曲线主峰是否跟阳性孔的主峰位置一致。如果一致,要看两者Cq相差多少,比如,针对某一种引物的实验样品Cq值为28. 5,阴性对照的Cq值为33. 6,由于Cq值相差大于5,如果按95%的扩增效率计算,两者模板量相差28倍之多,对分析数据影响不大,所以实验样品的Cq值还是可以采用的;但是,如果两者的Cq值相差 1~2,这说明阴性对照中有较大的模板污染,则需要考虑更换试剂或引物,分区加样,重新实验。如果不一致,阴性对照主峰对应的Tm值小于阳性孔的Tm值,则可能是引物性能不好,无模板或使用低浓度模板下会出现引物二聚体,这种情况则需要考虑更换引物,保证引物特异性以及扩增效率。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。上海灵敏度qPCR仪设置

使用 PCR 扩增 DNA 是当今实验室的一项基础技术,创新不断将其应用范围从研究实验室扩展到临床。定量 PCR (qPCR) 允许对靶 DNA 进行相对定量,并且是一种可靠的、已建立的测试特定序列是否存在的方法(例如,大多数基于 PCR 的冠状病毒测试使用 qPCR)。另一种 PCR 形式,数字PCR (dPCR) 或液滴数字 PCR (ddPCR),使用类似的化学方法检测 DNA 序列,但在许多微小体积或液滴中进行检测,利用数学的力量提高信噪比。qPCR和 dPCR 有很多相似之处和不同之处,但在与 PCR 专家交谈时,有几个重要的品质更加突出。尽管 dPCR 可能在灵敏度方面表现出色,但 qPCR 仍然是许多其他应用的比较好选择。“我们建议我们的客户在基因表达中使用 qPCR,因为它的动态范围很广;其量化不同表达水平、区分剪接变体和多重分析的能力;及其高通量应用和自动化的能力,”Alsarraj 说。事实上,它在实验室和监管环境中更为人所知,并用于基因、健康状况或传染病的筛查。佛山节省qPCR仪报价Taqman探针法因特异性高,被广泛应用于等位基因鉴别、SNP分型、病原体和病毒检测、多重定量等。

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SYBR Green I染料法实时定量PCR反应在带透明盖的塑料小管中进行,激发光可以直接透过管盖,激发荧光探针。荧光探针事先混合在PCR反应液中,只有与DNA结合后,才能够被激发出荧光。随着新合成目的DN段的增加,结合到DNA上的荧光探针增加,被激发产生的荧光也相应增加。简单的DNA结合的荧光探针是非序列特异性的,以非饱和染料中常用的SYBR GreenI染料为例,这种荧光染料激发光波长520 nm,只能与双链DNA结合,与DNA双链结合时,荧光强度出现明显增大的非特异性染料。每形成一条DNA双链,就有相应数量的SYBR Green I染料嵌入并产生荧光,因此荧光信号强度变化与PCR产物浓度变化呈正相关,原理如图2所示。耀海在进行质粒拷贝数测定时采用qPCR染料法,即大肠杆菌克隆表达得到的质粒DNA,其菌种质粒拷贝数的测定采用荧光定量PCR法。以质粒中卡那霉素抗性基因序列为靶标基因设计扩增引物,建立基于SYBR的qPCR检测方法,用于某大肠杆菌菌种中质粒拷贝数的检测。Real-timePCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。

qPCR的荧光标记方法分为以SYBR Green I染料法为主的荧光染料嵌合法,以Taqman探针法为主的荧光探针法(Cycling Probe,Molecular Bracon等),淬灭染料引物法。SYBR Green I 是高灵敏度的非特异性双链DNA荧光染料,具有绿色激发波长。它以非特异性方式结合在dsDNA双螺旋小沟区域。游离的SYBR Green I 只发出极弱的荧光信号,PCR过程中,当扩增生成dsDNA时,SYBR Green I 逐渐与dsDNA结合,荧光信号被千倍放大,荧光信号的强度与扩增得到的dsDNA的浓度成正比。荧光信号被仪器检测并采集得到“扩增曲线”,通过荧光信号的强度反映出体系中dsDNA的浓度。qPCR扩增效率100%的理想条件下的PCR反应,PCR产物量呈指数倍增长Yn=Y0×2^n。佛山高效qPCR仪供应商

QPCR用于基因表达研究、转基因研究,药物疗效考核、病原体检测等诸多领域。上海灵敏度qPCR仪设置

qPCR扩增效率100%的理想条件下的PCR反应,PCR产物量呈指数倍增长Yn=Y0×2^n(X0:初始模板量,n:PCR循环次数,Yn:第n次循环后的产物量)而实际PCR扩增时可能存在模板质量不佳引起的PCR扩增抑制,DNA聚合酶的种类及活性影响,非特异性扩增产物的竞争等情况,扩增效率无法达到100%。扩增初期,PCR产物指数倍增加,随着PCR产物的累积,各种影响因素的叠加,PCR产物不再指数倍增加,每个循环后产物增加量恒定,进入线性增长期,dNTP消耗殆尽,酶逐渐失活,扩增“停滞”,产物量恒定,进入平台期。非理想条件下的PCR反应:PCR产物量Yn=Y0(1+Ex)^n(Ex:扩增效率)。上海灵敏度qPCR仪设置

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