北京FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白组学

时间:2024年05月21日 来源:

作为免疫系统的重要组成部分,IgA在自身免疫性疾病、过敏反应、胃肠道疾病等许多不同的健康状况中发挥作用。在天然条件和复杂生物样品中选择性和特异性消化IgA的能力在临床医学和研究中具有重要价值。IgASAP酶是降低zhiliao性IgA候选物样品复杂性并简化IgA分析表征的宝贵工具。人IgA1和IgA2之间的一个显着结构差异是铰链区域。与IgA2相比,IgA1具有更长的富含O-聚糖且更灵活的铰链区域。IgASAPSub1的消化位点位于该扩展区域,使酶具有IgA1特异性。IgA2亚类以三种等位基因形式存在,A2m1、A2m2和A2m3。IgASAPSub1+2在脯氨酸(P)和缬氨酸(V)之间消化IgA1和IgA2m1只有N端到铰链区域,但由于A2m2和A2m3中的脯氨酸残基被精氨酸(R)残基取代,因此这两种同种异体型的IgA2对消化具有抗性。获得完整Fab和Fc抗体片段,用于结晶和高阶结构 (HOS) 的 NMR 研究、结合研究等。北京FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白组学

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Genovis除了提供IdeS酶以外,还提供很多种特异性蛋白酶,如半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA (IgdE)。IgdE 在铰链正上方的一个特定位点消化人 IgG1,产生完整的 Fab 和 Fc 片段的均质池。它在pH值和盐浓度范围内具有活性,不需要任何还原剂或辅助因子。因此,与许多其他常用的蛋白酶相比,FabALACTICA不需要任何优化来避免过度消化。这使得FabALACTICA成为一种有吸引力的酶,例如在还原和非还原条件下的LC-MS分析、抗体高阶结构(HOS)的结晶和NMR研究、双特异性或多特异性抗体的表征、单价结合研究和完整的Fc聚糖分析。天津IdeS蛋白酶蛋白组学Genovis提供的IgASAP Sub1+2 在铰链上方的一个特定位点消化人 IgA1 和 IgA2m1,产生完整且均匀的 Fab 和 Fc 片段。

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对于携带突变铰链的 Fc 融合蛋白或抗体来说,Fab 和 Fc 片段的生成可能具有挑战性。Genovis的GingisKHAN酶在铰链上方一个可触及的赖氨酸位点消化人IgG1,在足够温和的还原条件下保留链内和链间二硫键,从而产生完整的Fab和Fc片段。对于融合蛋白,消化通常在铰链上方获得,但融合伴侣的结构和氨基酸序列可能导致其他暴露的消化位点。如果去除保守的 Fc N-聚糖,Fc 中的第二个切割位点也可能被GingisKHAN酶切。将精选的单克隆人 IgG1 抗体和 Fc 融合蛋白与 GingisKHAN 在 37°C 下孵育 1 小时,并通过 HPLC 进行分析。

与IdeS不同,Genovis的GingisREX(RgpB)是一种精氨酸特异性蛋白酶,可消化精氨酸残基的C末端蛋白质,包括难以与其他酶消化的Arg-Pro键。该酶可用于肽图分析、从头肽测序和翻译后修饰分析。精氨酸残基的特异性C-末端消化;在其他困难的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化;产生更长的肽-提高序列覆盖率。GingisREX是一种半胱氨酸蛋白酶,可特异性地消化肽键C末端到精氨酸残基,包括与脯氨酸相连的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。与胰蛋白酶消化相比,可生成更长的肽,胰蛋白酶消化可以通过高分辨率质谱进行分离和鉴定。这为自下而上方法的样品制备提供了更多选择,以实现替代的酶解曲线和更高的序列覆盖率。GingisREX在赖氨酸上没有活性,通常使用Arg-C观察到。该酶在5.0-9.0的宽pH值范围内具有活性,它需要半胱氨酸并被盐酸胍抑制。该酶是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。消化在1小时内完成,且具有特异性。即使孵育时间延长,也没有过度消化的风险。

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Genovis将固定化酶固定在磁珠上,用于在铰链下方自动消化IgG。FabRICATOR(IdeS)是一种IgG特异性半胱氨酸蛋白酶,可消化铰链下方单个氨基酸位点的抗体,产生均质的F(ab')2和Fc片段。FabRICATORMagIC磁珠含有FabRICATOR固定化酶。这些微球能够在中级表征工作流程中并行快速自动酶解多种抗体。它们专为自动化平台而设计,但在无法实现自动化的情况下,在振动台上的表现同样出色。酶切消解后,样品可直接转移到LC-MS的自动进样器进行快速色谱分析,或转移到其他分析方法进行分析。自动平行抗体酶切和亚基生成允许处理与克隆选择、工艺开发和潜在生物制药稳定性研究相关的大量样品。自动抗体亚基分析可减少操作人员的时间和样品处理错误的风险,并提高通量。Genovis酶的适应于克隆筛选,工艺开发和验证以及稳定性研究,也适用于受控环境中的批次放行方法。上海FabRICATOR ZIdeS蛋白酶抗体酶切

可消化精氨酸残基的 C 末端蛋白质,包括难以与其他酶消化的 Arg-Pro 键。北京FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白组学

与IdeS不同,Romiplostim 由四个相同的血小板生成素 (TPO) 受体结合肽和一个 Fc 片段组成,通过柔性聚甘氨酸序列连接在一起。与度拉糖肽类似,用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 在 37°C 下过夜,或用 GlySERIAS 冻干 1 小时并在 37°C 下过夜消化该蛋白质。 链间二硫键被还原,以便于通过反相LC-MS进行以下分析。与度拉糖肽的观察结果类似,用固定化酶消化产生均质的 Fc/2,剩下一个连接子残基,此处为甘氨酸残基。这有助于识别专门位于Fc区域的修改。用冻干酶消化 1 小时得到 Fc/2,剩余 4 个甘氨酸残基和少量的 Fc/2 仍与一个 TPO 肽连接。另一方面,这使得研究 Fc/2 和第yi个肽之间的连接区域成为可能,而不会受到第二个肽的干扰。用 GlySERIAS 冻干液过夜消化产生 2 个 Fc/2 变体,分别剩下 4 个和 1 个甘氨酸残基。根据消化时间的不同,使用冻干产物释放的肽以五或七种变体存在,接头中残留的甘氨酸残基数量不同,而使用固定化产物释放的肽以四种变体存在。北京FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白组学

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