河北GlycINATORIdeS蛋白酶蛋白组学

时间:2024年07月09日 来源:

当你应用像肽图这样的方法时,你可以从Genovis中级方法中获得的信息量就没有那么多了。一个主要的区别是你不能像在肽水平上那样将修改定位到单个氨基酸。然而,中级分析比肽图谱具有快速和简单的巨大优势,因为需要分析的色谱峰要少得多,数据处理任务要简单得多。此外,在中级实验中,手工实验步骤要少得多,FabALACTICA(IdeS)酶切消化方法不需要针对不同的人体IgG1进行优化。一旦在氨基酸水平上进行了PTM表征,我们非常认为中级表征肽图的一种补充方法,可以在更常规的基础上应用。中级分析更适用于高通量或监测类型的方法,并可用于支持肽图分析。FabRICATOR (IdeS) 是一种 IgG 特异性半胱氨酸蛋白酶。河北GlycINATORIdeS蛋白酶蛋白组学

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蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。河北GlycINATORIdeS蛋白酶蛋白组学能够在中级表征中并行快速自动酶解多种抗体。

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与IdeS不同,Genovis的GlySERIAS是一种独特的酶,可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白连接子,例如Gly4Ser和GlyxSery(GS)以及聚甘氨酸(G)接头。该酶能够分离多功能融合蛋白的各个结构域,以促进表征并增加对这些分子的理解。融合蛋白的中级分析既可以降低整体样品的复杂性,又可以对翻译后修饰进行结构域特异性鉴定和监测。为了改善连接子的去除,Genovis建议使用GlySERIASImmobilized。对于连接子表征,我们推荐GlySERIAS冻干。具有柔性接头的独特酶消化融合蛋白;中级方法可降低融合蛋白表征的复杂性;复杂融合蛋白的可靠且可重复的消化。Genovis的GlySERIAS酶切由甘氨酸或甘氨酸和丝氨酸残基的重复序列组成的柔性连接子。该酶在天然反应条件下具有活性,能够对复杂的融合蛋白进行中级表征。连接子区域同时在多个位点被消化,导致先前连接的组分分离。活性发生在pH7.6下,孵育时间可以根据所需的产物而变化。GlySERIAS是从噬菌体K克隆而来的,在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为18kDa。

一些应用(如结合研究)具有高度灵敏度,因此在制备中需要不含残留酶的纯抗体片段。因此,Genovis的 IgG 特异性蛋白酶也以固定化酶提供,可快速轻松地生成均质 F(ab')2 和 Fc/2 片段。FabRICATOR Immobilized 含有固定化的 FabRICATOR (IdeS),用于制备来自多种 IgG 的 F(ab')2 和 Fc 片段(对于兔 IgG,请咨询),而小鼠 IgG2a 和 IgG3 可以使用含有 FabRICATOR Z Immobilized 的 FabRICATOR Z Fab2 试剂盒进行处理 。 为了生成和纯化完整的 F(ab')2 和 Fc/2 片段,使用 FabRICATOR Fab2 试剂盒处理曲妥珠单抗,并通过 SDS-page 进行分析。首先,在室温下在FabRICATOR固定化离心柱上消化抗体15分钟,然后进行短离心步骤。在 CaptureSelect ™ 离心柱上纯化 F(ab')2 片段,并通过降低 pH 值,然后立即调整回中性 pH 值,一步洗脱结合的 Fc 片段。使用 FabRICATOR Fab2 试剂盒从酶切到收集片段的过程大约需要 1 小时Genovis的IgASAP 是 IgA 消化酶家族。

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大多数zhiliao性抗体都携带人IgG1骨架,双特异性和多特异性形式的开发正在迅速增加。此类抗体的分析需要特异性酶来表征特性,例如单价结合、二硫键扰乱和配对Fc糖基化。传统方案包括使用木瓜蛋白酶和Lys-C的酶消化,这需要优化以极大限度地减少过度消化并获得足够的产量。Genovis的FabDELLO与IdeS酶具有不同的特异性,它在铰链上方的单个位点消化人IgG1,并产生完整的Fab和Fc片段。为了证明FabDELLO的特异性活性,通过非还原SDS-PAGE消化和分析了IgG1和Fc融合蛋白的选择。所有底物均实现了完全消化,包括具有其他困难的LALA和LFLE突变的IgG1。FabDELLO酶在底物上的精确和有效性能验证了其在生物制药开发中的用途。该酶在pH 值范围为 5.0 至 9.0 时显示出活性。辽宁GlySERIASIdeS蛋白酶

为了分别研究度拉糖肽的肽和 Fc 区域,从而鉴定结构域特异性 PTM。河北GlycINATORIdeS蛋白酶蛋白组学

LC-MS中级分析是一种被大众接受的分析方法,用于快速表征mAb和其他基于IgG的生物制药。它有助于理解多种关键质量属性 (CQA),例如糖基化、氧化和 C 端赖氨酸剪切。这种关于翻译后修饰(PTM)的详细知识是生物制药开发和制造所必需的。Genovis的FabRICATOR HPLC酶色谱柱,可快速进行单克隆抗体的柱上酶切,并产生一致的亚基。该色谱柱含有固定化的FabRICATOR(IdeS)酶,可在铰链下方快速且特异性地消化IgG,产生F(ab')2和Fc片段,而不会出现任何过度消化的风险。为了减少样品处理并为样品制备提供自动化解决方案,FabRICATOR被共价固定在树脂上,并装在适用于HPLC的PEEK色谱柱硬件中。使用FabRICATOR HPLC色谱柱,只需稍作修改,即可使用标准HPLC-MS装置自动生成抗体亚基。然后,FabRICATOR HPLC色谱柱上消解产生的亚基被捕获在在线连接的反相(RP)色谱柱的柱头上。河北GlycINATORIdeS蛋白酶蛋白组学

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