北京RNA提取可测序

时间:2023年06月10日 来源:

动物组织块DNA提取:1.组织块解冻,用生理盐水洗去血污,剪取约0.5g组织,放入1.5ml离心管中,剪碎。2.加入0.45mlTES混匀,再加入50ulSDS(10%),5.0ul蛋白酶K(20mg/ml),充分混匀后,于56°C保温4-6h,每2h摇1次。3.放置到室温,加入等体积饱和酚(500ul),颠倒混匀,10000r/m,离心10m,分离水相和有机相,小心吸取上层含核酸的水相,到一个新的1.5ml离心管。4.加入等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),颠倒混匀,10000r/m,离心10分钟,取上层转移到新的1.5ml离心管中。5.加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),颠倒混匀,10000r/m,离心10分钟,取上层清液到一个新的1.5ml离心管。6.加入2.5倍体积的-20°C预冷的无水乙醇沉淀DNA,观察现象。7.12000r/m,离心10分钟,弃乙醇。8.-20°C保存的75%乙醇洗涤,10000r/m,离心5分钟,去乙醇,55°C干燥DNA。9.加入适量TE溶解DNA(具体依DNA的多少而定),-20°C保存备用。DNA提取是生物学和分子生物学领域中常用的实验技术之一。北京RNA提取可测序

骨组织RNA提取之其它骨组织破碎方法:确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。将基因组DNA清理柱子放在一个干净2ml离心管内(不用RNAsefree或者DEPC处理,一般干净的新离心管即可。也可使用RNA吸附柱配套的新的干净收集管),在基因组清理柱内加500μl裂解液RLTPlus,13,000rpm离心30秒,收集滤液(RNA在滤液中),用微量移液器较精确估计滤过液体积(通常为450-500μl左右,滤过时候损失体积应该减去),加入0.5倍体积的无水乙醇,此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。青岛无需氯仿RNA提取哪家好DNA提取的质量可以通过测定纯度、浓度和完整性来评估。

microRNA富集提取方法及步骤:1.较精确估计滤过物体积,加入0.65倍体积无水乙醇(必须是室温的),涡旋或者吹打充分混匀,不要离心。2.取一套新的microRNA吸附柱MA,将上一步骤混合物(每次小于700μl,多可以分两次加入)加入microRNA吸附柱MA中,(吸附柱放入收集管中)12,000rpm离心30秒,弃掉废液。3.按照前面标准操作步骤操作漂洗,洗脱得到富集的microRNA。注意:不同的实验可以选择不同的方法,例如NorthernBlot或者表达芯片谱分析可以选择提取包括microRNA的总RNA。富集方法提取的microRNA因为去除了较大片段的mRNA和rRNA等,可能减少某些下游试验的扩增背景,当背景较高或者非特异扩增较多时,可以尝试使用富集方法提取的microRNA。

过柱法DNA提取的工作原理:独特的结合液/蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸酶,然后基因组DNA在高盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,较后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。1、采用离心吸附柱和缓冲液系统。样品裂解后,DNA在高盐条件下与硅胶膜结合,在低盐、高PH值时从硅胶膜上洗脱下来。2、破坏红细胞,通常利用红细胞与白细胞膜结构的差异,先使红细胞裂解,经离心后收集白细胞。3、白细胞裂使膜蛋白和核的蛋白变性,游离DNA,通常是采用离子型表面活性剂使蛋白质变性。4、除去变性蛋白质:通常采用蛋白沉淀剂沉淀变性蛋白质,使DNA留在上清液中。5、在高盐环境下使DNA从有机溶剂(如无水乙醇)中析出。DNA提取的样品准备之单层培养细胞:可用刮棒或胰酶消化后离心收集。

RNA提取的一些问题,RNA降解:提取的材料不新鲜。新鲜组织取得后应立即置于液氮中或立即放入RNAstore试剂中,以保证提取效果。处理样品量过大。污染了RNase。虽然试剂盒中提供的缓冲液都不含RNase,但使用过程中很容易污染RNase,应小心操作。碱裂解法提取的质粒DNA进行琼脂糖电泳进行鉴定时,看到的三条带分别是什么?碱法抽提得到质粒样品中不含线性DNA,得到的三条带是以电泳速度的快慢排序的,分别是超螺旋、开环和复制中间体(即没有复制完全的两个质粒连在了一起)。如果你不小心在溶液II加入后过度振荡,会有第四条带,这条带泳动得较慢,远离这三条带,是20-100kb的大肠杆菌基因组DNA的片断。RNA提取可以用于研究RNA的降解和稳定性。天津血浆DNA提取哪家好

DNA提取的样品准备之血液样品:血液抗凝易用柠檬酸抗凝液。北京RNA提取可测序

RNA提取中常见的问题:OD260/OD280比值偏低:蛋白质污染:确保不要吸入中间层及有机相。减少起始样品量,确保裂解完全、彻底。加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心分层的离心力和时间要足够。如果所得RNA的OD260/OD280比值偏低,则用氯仿重新抽提一次,再沉淀,溶解。苯酚残留:确保不要吸入中间层及有机相。加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心分层的离心力和时间要足够。多糖或多酚的残留:一些特殊的组织和植物中,多糖、多酚含量较多,这些残留也会导致OD260/OD280比值偏低。因此,从这类材料中提取RNA时,需要注意多糖、多酚杂质的去除。设备限制:测定OD260及OD280数值时,要使OD260读数在0.1-0.5之间。此范围线性较好。用水稀释样品:测OD值时,对照及样品稀释液请使用10mMTris,pH7.5。用水作为稀释液将导致比值偏低。北京RNA提取可测序

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