吉林基因组学高通量筛选

时间:2022年11月02日 来源:

高通量筛选技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测数以千万的样品,并以得到的相应数据库支持运转的技术体系,它具有微量、快速、灵敏和准确等特点。简言之就是可以通过一次实验获得大量的信息,并从中找到有价值的信息。高通量筛选时每天要对数以千万的样品进行检测,工作枯燥,步骤单一,操作人员容易疲劳、出错。自动化操作系统由计算机及其操作软件、自动化加样设备、温孵离心设备和堆栈4个部分组成。自动化操作系统代替人工操作显然有诸多优势,它利用计算机通过操作软件控制整个实验过程,编程过程简洁明了。高通量筛选技术原理。吉林基因组学高通量筛选

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配备多种通量的自动加样系统(96/384/1536通道),以LED为光源,采用高灵敏度的CCD相机完成整板信号的同步加样和实时检测(荧光和化学发光均能检测),准确再现受体或离子通道快速动力学反应过程。适用于生命科学基础研究和高通量药物筛选。同时FLIPRPenta高通量实时荧光检测分析系统还提供了一个新的高速相机配置和新的PeakPro2软件模块,可以帮助您检测和分析人iPSC衍生的心肌细胞和神经元的钙振荡模式。图像可以以每秒100次的速度进行信号采集,并使用30多种不同的测量方法快速分析模式。吉林基因组学高通量筛选高通量筛选研究现状。

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在报告基因检测(也称为信号通路检测)中,报告蛋白的序列编码是在相关通路的转录控制下引入的。通过荧光或光学读数监测报告基因的表达,通过这些指标来间接反应启动子的或抑制程度。观察到的信号是整个通路的产物,筛选的化合物可以在该通路上的任何点相互作用。常见的报告基因是CAT(氯霉素乙酰转移酶)、GAL(β-半乳糖苷酶)、LAC(β-内酰胺酶)、LUC(荧光素酶)和GFP。我们通常使用的为LUC(荧光素酶),但也可以使用其他报告基因。

高通量的抗体制备,筛选技术不仅可以的提高工作效率,而且可能提高双特异抗体筛选的成功率。接下来介绍三类双特异抗体高通量筛选技术,包括双特异抗体的制备,双特异抗体的质量分析等。为了能够筛选到针对自身性免疫疾病如SLE(系统性红斑狼疮)的双特异抗体,作者对B细胞表面的23个靶点进行单克隆抗体的筛选,每个靶点有1-8个候选的单克隆抗体,并且这些抗体没有进行过亲合力或者表位的预先筛选。双特异抗体是为了模拟双抗结构而建立的平台,该平台中,双抗包括两个部分Fab-X (Fab-scFv) 和 Fab-Y (Fab-peptide)。为了能够筛选到针对自身性免疫疾病如SLE(系统性红斑狼疮)的双特异抗体,作者对B细胞表面的23个靶点进行单克隆抗体的筛选,每个靶点有1-8个候选的单克隆抗体,并且这些抗体没有进行过亲合力或者表位的预先筛选。传统高通量筛选设备。

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为了避免频繁命中化合物对实验干扰,许多实验方法,例如采用qHTS、ADP-Glo等更先进高通量筛选方法,或者采用交互实验验证等用于增强筛选结果可行度。此外,随着更多晶体结构发现分享和生物实验数据库整理,频繁命中化合物的探索变得更加可行。为人熟知且使用的就是PAINS(Pan-assay interference compounds)筛选规则。这是Baell等人在2010年基于六个不同靶点高通量筛选实验结果,并将其中频繁出现(≥4次)的化合物和相关结构总结为包含480个子结构的筛选规则。但这类规则主要针对的是化学易反应化合物,且PAINS规则本身也有很大局限性,因此,频繁命中化合物相关筛选预测工具的开发仍然是现今研究热点。在2017年,一篇由九名美国化学学会杂志主编联名发表的文章“The Ecstasy and Agony of Assay Interference Compounds”中强调了实验干扰引起的假阳性化合物的危害,告诫研究人员对筛选得出的阳性结果真实性需要反复确认,对潜在的假阳性结果需要提高警惕。为了更深入的了解频繁命中化合物和相关机制。高通量筛选技术的方法有哪些。湖南细胞高通量筛选

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