Recombinant Human SMOC1 Protein
EndoH糖苷内切酶H在实验中的特异性和效率通常通过以下几个方面来确定:1.**特异性识别**:EndoH能够特异性地识别并切割高甘露糖型N-连接糖链,这些糖链通常存在于未成熟的糖蛋白中。2.**切割位点**:EndoH识别并切割壳二糖结构中的β-1,4-糖苷键连接的甘露糖型结构糖链,但不能切割复杂型糖链糖蛋白。3.**酶活性测试**:通过使用标准糖蛋白底物进行酶活性测试,可以确定EndoH的活性和效率。4.**纯化效果**:EndoH的纯度可大于95%,这有助于确保实验中酶的高效性。5.**比较分析**:与其他去糖基化酶(如PNGaseF)进行比较分析,可以评估EndoH的特异性和效率。6.**应用效果**:EndoH用于基于DNA测序的荧光辅助糖电泳(DSA-FACE)分析核糖核酸酶B(ribonucleaseB,RNaseB)的糖基结构,可以比较不同酶的糖基切割功能。7.**酶切时间**:EndoH的酶切时间通常为1-3小时,这有助于评估酶的效率。8.**产品信息**:通过查看产品信息,包括产品编号、规格和目录价,可以了解EndoH的商业可用性和应用范围。通过这些方法,研究人员可以确保EndoH在糖链分析中的特异性和效率,从而获得准确的糖链结构信息。去泛素化酶(Deubiquitinating enzymes, DUBs)可以去除泛素化蛋白上的泛素链,使泛素分子得以回收和再利用。Recombinant Human SMOC1 Protein,His Tag
在基因编辑中,除了NLS-Cas9-EGFPNuclease,还有多种技术可以提高编辑的特异性,这些技术包括:1.**高保真Cas9变体**:通过工程化改造Cas9蛋白,例如使用SpCas9-HF1或eSpCas9等高保真变体,可以减少脱靶效应,提高特异性。2.**碱基编辑器(BaseEditors)**:这类编辑器可以在不产生DNA双链断裂的情况下直接在特定位置进行单个碱基的转换,从而减少非目标编辑。3.**引导编辑器(PrimeEditors)**:由哈佛大学刘如谦教授团队开发的引导编辑器可以在不依赖DNA双链断裂和同源定向修复的情况下,实现精细的基因组编辑。4.**CRISPRi和CRISPRa**:这两种技术分别用于抑制或激起特定基因的表达,而不切割DNA,从而减少了脱靶风险。5.**新型CRISPR系统**:例如CRISPR/Cas12j和CRISPR/CasΦ,这些系统可能具有不同的PAM序列要求和更高的特异性。6.**AI辅助设计**:利用人工智能预测和优化sgRNA的设计,以减少脱靶效应。7.**优化递送系统**:改进CRISPR组分的递送方法,例如使用核糖核的蛋白(RNP)复合物,可以提高编辑效率和特异性。8.转座子编辑系统:利用转座子进行基因组编辑,可以在不依赖DNA双链断裂的情况下实现大片段DNA序列的插入。
EndoS糖苷内切酶S在抗体药物偶联物(ADCs)研究中的应用主要体现在糖链定点偶联技术上。通过上海药物所的研究,开发了一种新颖的糖链定点ADC制备策略,利用EndoS2这种糖苷内切酶,可以将小分子细胞毒药物“一步”定点连接到抗体的糖基化位点,实现了糖链定点ADC化合物的制备。定点偶联技术相比传统的随机偶联具有更好的方法指数,能够提高ADC的均一性和稳定性,是当前ADC领域的研究热点之一。在抗体的Fc结构域N297位,这是一个保守的糖基化位点,通过在该位点引入细胞物质,可以形成具有优势的糖链定点ADC化合物(glycosite-specificADCs,gsADCs)。此外,EndoS2对多样化的LacNAc修饰显示出良好的兼容性,能够高效获得功能修饰的糖工程抗体,并且可以用于抗体的内吞成像研究及糖链延伸等功能化研究。研究人员通过这种“一步”制备策略得到的糖链定点ADC化合物,在结构均一性、亲水性、体外稳定性以及体外活性方面表现良好,并且在体内瘤抑制活性方面,相比阳性对照ADC化合物,在低载药量的情况下具有更强的抑制效果。EndoS酶的这些应用,不仅展示了其在简化ADC制备流程中的潜力,还有助于推动定点ADC药物的深入发展,为未来的生物药物开发提供了新的思路和方法。
通过EndoS糖苷内切酶S进行糖蛋白的糖链结构分析通常涉及以下步骤:1.**样本准备**:首先,需要获得糖蛋白的纯化样本,以确保分析的准确性。2.**酶的准备**:准备适量的EndoS糖苷内切酶S,根据实验需要选择合适的浓度和缓冲体系。3.**酶切反应**:-将糖蛋白样本与EndoS酶混合,在适宜的条件下(如pH、温度等)进行酶切反应。-反应时间根据EndoS的活性和所需的切割程度来确定。4.**终止反应**:在达到预期的酶切时间后,通过加热或添加适当的缓冲液来终止酶切反应。5.**分离纯化**:-使用色谱技术(如凝胶渗透色谱、离子交换色谱等)将酶切后的糖蛋白和释放的糖链分离。-纯化过程可能需要多步色谱以确保糖链的纯度。6.**糖链分析**:-对分离得到的糖链进行进一步的结构分析,可能包括质谱分析、核磁共振(NMR)波谱分析等。-可以使用高分辨率的质谱技术,如MALDI-TOF或ESI-MS,来确定糖链的精确质量。7.**序列鉴定**:通过与已知糖链数据库比对,确定糖链的序列和结构。8.**功能分析**:研究酶切后的糖蛋白和释放的糖链对生物活性的影响,如结合特性、免疫原性等。9.**数据分析**:收集所有数据并进行综合分析,以揭示糖链结构与功能之间的关系。
酵母重组表达的N-糖苷酶F(PNGaseF)是一种酰胺水解酶,具有以下特点:1.**高效性**:PNGaseF是去除几乎所有N-连接寡糖从糖蛋白中有效的酶法方法。它能够在几分钟内快速且无偏倚地释放所有的N-糖链,适合后续的色谱或质谱分析。2.**重组酶**:该酶是重组的酰胺酶,能够从高甘露糖、杂合和复杂寡糖中切割内GlcNAc和天冬氨酸残基之间的连接。3.**纯度**:纯度达到95%以上,通过SDS-PAGE和完整ESI-MS进行确定。4.**储存稳定性**:在含有50%甘油的储存缓冲液中,好的活性和稳定性可维持长达24个月。5.**使用条件**:可以在原生或变性条件下使用,对于变性条件下的去糖基化,建议添加NP-40以解除SDS的抑制作用。6.**比活性**:具有高达100000U/mL的比活性。7.**His标签**:产品带有His标签,常用于抗体及其相关蛋白的完全去糖基化。8.储存条件:-25~-15℃保存,有效期1年。9.**无甘油版本**:还提供了无甘油版本的PNGaseF,这有助于在HPLC和质谱分析中获得结果。10.**酶活定义**:1个酶活力单位指在10μL的反应体系中,37℃条件下1小时从10μg变性RNaseB中除去超过95%的碳水化合物所需要的酶量。这些特点使得酵母重组表达的PNGaseF成为研究和分析糖蛋白糖链结构的重要工具。去泛素化酶可以去除泛素化标记,这一步骤是泛素化过程的逆转过程,它允许细胞对泛素化事件进行精细调控。Recombinant Human SMOC1 Protein,His Tag
Cas12a同源物能够识别更简单的PAM序列(如5-TTN),这使得基因组的覆盖率显著提高。Recombinant Human SMOC1 Protein,His Tag
EndoS糖苷内切酶在ADCs制备中的具体应用步骤,根据上海药物研究所的研究,可以概括为以下几个关键环节:1.**筛选糖底物和糖苷内切酶**:研究人员筛选了一系列糖底物和糖苷内切酶,发现Endo-S2酶能够将二糖底物LacNAc转移至去糖抗体N297位糖基化位点,且LacNAc半乳糖6号位唾液酸化修饰不影响Endo-S2的转糖基化活性。2.**抗体糖基化改造**:利用Endo-S2和LacNAc的组合,直接实现野生型抗体的糖基化改造。Endo-S2对多样化LacNAc修饰的兼容性,可以高效获得功能修饰的糖工程抗体。3.**设计合成药物-连接子复合物**:研究人员设计并合成了LacNAc-linker-drug复合物结构,这是实现定点ADC化合物“一步”组装的关键。4.**“一步”定点偶联**:通过Endo-S2的催化作用,将小分子细胞毒药物通过特定的糖链结构直接定点连接到抗体的糖基化位点,简化了ADCs的制备流程。5.**评价和测试**:对获得的糖链定点ADC化合物进行结构均一性、亲水性、体外稳定性及体外活性的测试。测试结果显示,这些化合物具有非常好的结构均一性(DAR=2)、亲水性和体外稳定性,并且在体外具有强大的瘤抑制活性。