Recombinant Human Persephin
CUT&RUN和ChIC是两种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,它们有一些关键的区别:1.**技术原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技术利用抗体将感兴趣的蛋白与ProteinA-MNase相结合来进行DNA切割。ChIC的优势在于使用TF特异性抗体系住MNase,并只在结合位点裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技术则是在核的轻微MNase处理后释放单核小体和TF-DNA复合物,留下寡核小体。CUT&RUN通过在冰上进行简短的消化反应,在TF结合的MNase扩散到周边的基因组和裂解可接近的染色质之前在上清中恢复TF-DNA复合物。2.**操作步骤和简便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,这可能重新引入了ChIP-seq的一些问题,如交联导致的DNA和蛋白质的化学修饰。-**CUT&RUN**:CUT&RUN简化了操作步骤,使用磁珠固定细胞核,适用于新鲜和冷冻组织样本,缩短了生成DNA测序文库的时间(1-2天)。3.**背景信号和信噪比**:-**ChIC**:ChIC产生的背景信号可能较高,因为它可能涉及到非特异性的DNA切割。
牛痘DNA拓扑异构酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)是一种来源于牛痘病毒的I型真核拓扑异构酶,具有以下功能和应用:1.**功能**:-牛痘DNA拓扑异构酶I可以催化双链DNA分子中单链DNA特定序列位置的磷酸二酯键的断开和连接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性,能够通过快速的酶切和连接使双链共价闭合环状的正或负超螺旋DNA发生解超螺旋,形成含有较少的正或负超螺旋的双链环状DNA分子。-能够使双链DNA形成绳结(knotting)或解开绳结(unknotting),联结互补的单链环状DNA成为双链环状DNA。2.**应用**:-作为一种DNA重组连接的新型工具酶,用于DNA载体和重组片段的连接、缺刻修复、接头连接等。-适用于TOPO克隆载体的制备、NGS建库中的接头连接等。-在TOPO克隆技术中,DNA拓扑异构酶I同时具有限制酶和连接酶特性,其生物学功能是在复制期间切割并重新连接DNA。3.**使用方法**:-用于DNA快速酶切流程,包括配制体系反应液、轻柔混匀、37℃孵育15分钟等步骤。4.**储存条件**:-建议在-25~-15℃保存,有效期为3年。5.**注意事项**:-避免起泡或剧烈搅拌、涡旋等操作,以防止酶失活。牛痘DNA拓扑异构酶I因其独特的功能,在分子生物学研究和基因工程中扮演着重要的角色。Recombinant Mouse ITGB6 Protein,His Tag使用 Tn5 转座酶可以保证 DNA的 片段化的质量,同时获得的蛋白纯度高、核酸残留低,能够为后续的实验。
核酸内切酶VIII(EndonucleaseVIII)是一种来自大肠杆菌的DNA损伤修复酶,具有以下特点:1.**双功能活性**:核酸内切酶VIII具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。2.**释放受损嘧啶碱基**:N-糖基化酶活性可以释放双链DNA上受损的嘧啶碱基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,生成一个脱嘌呤(apurinic,AP)位点。3.**切割AP位点**:AP裂解酶活性可以切割AP位点的3'和5'端,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。4.**识别并切除受损碱基**:核酸内切酶VIII可以识别并切除多种受损碱基,包括尿素、5,6-二羟基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基-5-甲内酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶和甲基羟丙二酰脲。5.**与EndonucleaseIII的区别**:虽然核酸内切酶VIII与核酸内切酶III相似,但核酸内切酶VIII具有β和δ裂解酶活性,而核酸内切酶III具有β裂解酶活性。6.**应用领域**:核酸内切酶VIII可以应用于单细胞凝胶电泳、NGS建库中DNA损伤修复、酶法合成DNA中释放DNA链、碱洗脱,搭配尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)进行含U片段的克隆等。
qPCR(定量聚合酶链式反应)检测结果的准确性可能受到多种因素的影响,以下是一些关键因素:1.**引物和探针设计**:引物和探针的设计质量对qPCR的成功至关重要。不合适的引物设计可能导致低特异性或效率低的PCR反应。引物的选择应考虑引物的长度、Tm值(解离温度)和GC含量,以确保其适用于特定的核酸模板。2.**模板质量和纯度**:模板的质量和纯度直接影响qPCR的结果。污染或降解的模板可能导致偏差或虚假阳性结果。使用质量高、纯度高的DNA或RNA样本是确保准确和可靠的qPCR结果的关键。3.**反应条件和缓冲液**:PCR反应条件,包括温度、离子浓度和缓冲液成分,必须严格控制。温度梯度、离子浓度的变化或缓冲液成分的误配可能会影响PCR效率。4.**反应容器和耗材**:反应管、微孔板、封闭膜等反应容器和耗材的质量也会影响qPCR结果。低质量的材料可能导致样本丢失或反应失效。5.**标准曲线和校准**:标准曲线的准备和校准非常重要。不正确的标准曲线可能导致定量结果的不准确性。确保标准曲线中包含适当的对照样品,并使用线性拟合来生成准确的定量数据。6.**环境条件**:实验室温度、湿度和空气质量都可以影响qPCR实验的结果。不稳定的环境条件可能导致实验结果的不稳定性。T4 DNA 聚合酶具有 5’→3’聚合酶活性,在模板及引物存在的条件下,能够在结合有引物的单链 DNA 模板上。
磁珠法PCR/DNA纯化试剂盒在科研中的应用非常广,主要包括以下几个方面:1.**PCR产物的纯化**:磁珠法试剂盒可以从PCR反应液中回收不同片段大小的DNA,有效去除酶、dNTP、盐类等杂质,回收率高,产物纯度好,可以直接应用于PCR、连接、测序、NGS建库等下游实验。2.**基因组DNA的提取**:适用于从血液、唾液、口腔拭子和动物组织等样品中分离纯化高质量基因组DNA,提取的DNA片段大,纯度高,质量稳定可靠,适合高通量工作站的自动化提取。3.**质粒DNA的提取**:磁珠用于从粗制的提取物中分离质粒DNA,通过精心优化的溶液将质粒DNA从基因组DNA和蛋白质中分离出来。4.**DNA片段的分离**:有许多类型的DNA分离试剂盒可供选择,包括DNA片段的分离。DNA片段可能需要为下一代测序协议进行分离,在这种情况下,可以用能选择分子大小的磁珠来分离片段。5.**自动化和高通量操作**:磁珠法试剂盒适合手工操作,也可用于自动化工作站或核酸自动提取仪,实现高通量操作。6.**分子生物学研究**:磁珠法试剂盒在基因组研究、分子进化研究等领域有广泛应用,为遗传病研究、筛查等提供了强有力的技术支持。其作用位点相对局限,主要作用于高甘露糖型和部分杂合型 N - 连接糖链,对于复杂型 N - 连接糖链的作用较弱。Recombinant Rat IL-1 beta Protein
Tn5转座酶高通量测序建库、ATAC-seq 等多种先进的分子生物学技术,能够与这些技术很好地结合。Recombinant Human Persephin
Cre重组酶在基因编辑中的操作主要涉及以下几个步骤:1.**识别与结合**:-Cre重组酶首先识别并分别结合两个LoxP序列的两个反向重复序列,形成一个二聚体。2.**四聚体形成**:-两个二聚体互相靠近,形成由四个Cre分子与两个LoxP位点结合形成的四聚体复合物。3.**DNA切割与交换**:-Cre重组酶在每个LoxP位点的间隔序列中引导单链切割,产生带有3’端羟基的断裂。每个LoxP位点的两个单链分别被切割。切割产生的自由3’端与对侧的3’端进行交换和重连,形成Holliday交叉结构。4.**分子重组与解旋**:-Holliday交叉结构通过Cre酶的作用被解旋并重组,形成新的重组产物。这个过程导致两个LoxP位点之间的DNA序列被删除、反转或易位,具体效果取决于LoxP序列的排列方式(方向和位置)。5.**条件性基因编辑**:-通过建立特异性Cre小鼠,该小鼠中的Cre重组酶由特定启动子驱动,可在特定细胞或组织或全身表达Cre重组酶。与带有Lox位点的Flox小鼠杂交,子代中可以获得既带有Cre又带有Flox基因的小鼠,实现条件性基因打靶(表达或敲除靶基因)。Recombinant Human Persephin